第二届全国基因组信息学大会

冷冻电镜（Cryo-EM）是解析生物大分子结构最重要的实验技术之一。获得目标分子的电子密度图后，需要从密度图中构建对应的原子模型。然而，模型搭建是一个复杂且劳动密集型的过程，并且通常依赖于对目标分子体系的先验知识。为提高建模的自动化程度和精度，我们开发了 EM2NA 和 EMProt 等方法，以应对这一挑战。EM2NA 和 EMProt 利用卷积神经网络，从密度图中自动提取关键原子的位置和残基类型信息，并结合几何约束的路径规划算法，对密度图中的核酸和蛋白质结构进行自动建模。这一流程显著提升了建模效率和准确性，为 Cryo-EM 密度图的自动化解析提供了有力工具。