Interrogation of the dynamic RNA splicing heterogeneity and the splicing regulation with machine learning 第二届全国基因组信息学大会

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Interrogation of the dynamic RNA splicing heterogeneity and the splicing regulation with machine learning

ID：64 View Protection：ATTENDEE Updated Time：2025-03-25 14:37:17 Hits：854 Oral Presentation

Start Time：2025-03-30 09:00（Asia/Shanghai）

Duration：30min

Session：S7 前沿论坛（基因组大数据与AI） » s7前沿论坛（基因组大数据与AI）

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Abstract

RNA可变剪接是高等真核生物中重要的转录后调控机制，体现了基因复杂功能的多样性与可塑性。当前主流的细胞异质性分析以单细胞基因表达谱为基础，几乎完全忽略了RNA可变剪接在塑造生理状态、执行生物学功能及驱动疾病发展中的关键作用。针对这一空白，我们开发了SCASL工具，重点解决单细胞RNA剪接数据的低覆盖度与高稀疏性问题，使用谱聚类机器学习方法绘制单细胞RNA剪接异质性图谱。基于剪接谱的细胞类群定义具有更明确的生物学与生理学意义，并更加精细地刻画了细胞发育、分化的动态过程。进一步，为探索剪接异质性的内在驱动力，我们开发了基于梯度增强集成学习的DSRIL工具，通过可解释性机器学习鉴定细胞特异的可变剪接调控因子，挖掘剪接异质性动态演化的驱动机制。研究成果为理解复杂生理病理过程提供了新的视角与工具。

Keywords

Speaker

杨雪瑞

教授 清华大学

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Important Date

Conference Date

Mar 28

2025

to

Mar 30

2025
Apr 15 2025

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中国农业科学院农业基因组研究所
大鹏湾实验室

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栾俊宇
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