第二届全国基因组信息学大会

本研究开发了一种全新的超低覆盖度全基因组测序（ulcWGS）基因型填充计算框架DPImpute，在基因组育种共性技术领域取得了重要创新性突破，其创新性体现在：采用两阶段填充策略，显著提升低覆盖度（≤0.1X）下的基因型一致性，且支持小参考群体（≤100个体）和小测试样本（≤10）的高精度预测，完美适配核心种群规模小、系谱数据有限的现状。全球首次实现单个动物囊胚细胞全基因组千万级SNP分型(准确度94.89%)，可预测眼肌面积、背膘厚度等经济性状，将选育周期缩短1-2个世代。相关研究成果以《DPImpute: A Genotype Imputation Framework for Ultra-low Coverage Whole-genome Sequencing and its Application in Genomic Selection》为题，于2025年2月27日在线发表于国际知名期刊（Advanced Science）。
DPImpute是通用型分子育种平台“万相育种加速器”的核心基因型检测模块。该平台在相关研究成果正式发表前即已实现产业化应用，先后荣获广东省首届种业科技创新大比武总决赛十强（2021年）和第二十四届中国国际高新技术成果交易会优秀产品奖（2022年）。平台的成功转化受到《中国科学报》专题报道，并应广东省委宣传部邀请，以“发展农业新质生产力，打造万相育种加速器”为主题作专题报告，并在《广东卫视》广东新闻联播栏目亮相。