从宏基因组数据挖掘微生物地理分布:以青藏高原为例
ID:10 View Protection:ATTENDEE Updated Time:2024-04-10 15:31:55 Hits:621 Oral Presentation

Start Time:2024-04-13 16:35(Asia/Shanghai)

Duration:15min

Session: 专题一:地质微生物学研究新理论、新技术与新方法 » 1专题一:地质微生物学研究新理论、新技术与新方法

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Abstract
微生物地理学旨在研究微生物在不同地理空间中的分布模式,关注它们的群落结构、生态功能和演化过程如何受到生态或地理因子的影响。目前的微生物地理学研究大多基于扩增子测序和生物多样性数据,推测微生物群落整体的分布模式,抑或基于纯培养菌株的基因组数据,推测特定物种的分布模式以及相关的环境驱动因素。但现有方法难以同时分析环境中多个物种的地理分布模式,并比较不同区域或不同物种之间的地理分布差异和环境驱动因素。本研究结合群体遗传学理论和高通量宏基因组测序数据,开发新的研究方法,可以大批量重构多个物种的地理分布模式。本研究将该方法应用于青藏高原湖泊环境,发现不同区域的湖泊微生物具有差异化的地理分布模式:高原中部的羌塘区域地势平坦,容易在全球变暖时期发生流域重组事件,这打破了不同湖泊之间的地理隔离,促进了微生物的遗传交流效率;而高原南部的雅鲁藏布区域遍布崇山峻岭,不同湖泊长期维持相对隔离的状态,微生物的地理分布模式更为明显。微生物地理学研究可以揭示微生物演化与环境选择、地质事件之间的相互关系,能够为地质事件的覆盖范围和发生时间提供微生物水平的证据,为地质微生物的后续探索提供新的研究思路。
Keywords
微生物地理分布,青藏高原湖泊,中性遗传多样性
Speaker
冯晓远
副研究员 深圳大学

Submission Author
冯晓远 深圳大学
李猛 深圳大学
罗海伟 香港中文大学
邢鹏 中国科学院南京地理与湖泊研究所
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Important Date
  • Conference Date

    Apr 12

    2024

    to

    Apr 14

    2024

  • Mar 28 2024

    Draft paper submission deadline

  • Apr 14 2024

    Registration deadline

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