第二届微生物生态与海洋环境论坛

通过新一代测序技术，测定16S rRNA等标签序列，是微生物生态学研究革命性的技术进步，目前已经迅速发展成为微生物组学相关研究的主流手段。其中，由于Illumnia测序的成本优势，使用越来越广泛；如何对高通量测序序列进行处理和计算，是相关技术的核心，也是传统微生物学研究团队用好该技术的瓶颈问题。去年学会及学员反应热烈，应微生物生态专委会要求，特开展第二期高通量测序数据分析培训班。今年结合16S rRNA测序QIIME分析，以及GeoChip芯片分析两大重要工具。继续邀请了QIIME开发者Rob Knight实验室开发团队核心成员和周宏伟教授及其团队主讲Illumnia测序数据分析及QIIME高级脚本的应用。同时，微生物群落研究已经从组成转到功能，功能基因芯片（GeoChip）技术也得到广泛应用，但其中的探针设计原理及数据解析仍为该技术应用的难题。将特邀GeoChip开发者周集中教授本人及团队核心成员为芯片部分培训主讲人。 论坛及培训班定于2014年10月17-22日在宁波举行。本次培训班宗旨是：（1）理解分析流程中采用相关步骤的科学背景；（2）学会并实际操作以QIIME为代表的微生物群落分析工具；（3）学会基因芯片数据分析的流程和注释。 高通量测序和基因芯片技术费用高、风险大，其实验设计的科学性及严谨性就显得特别重要，因此，我们邀请了周集中教授和其他著名微生物生态学和生物信息学专家就微生物生态学中科学问题凝练、实验设计及数据分析等问题做主题报告和研讨。